Отделение предназначено для оказания специализированной и высокотехнологичной медицинской помощи больным с нейрохирургической патологией, в том числе развившейся при чрезвычайных ситуациях природного и техногенного характера.
Нейрохирургическое отделение рассчитано на 25 коек, плюс 6 коек нейрореанимации. В составе блока медицинских технологий имеется нейрохирургическая операционная, оснащенная по стандарту европейских клиник класса А. Штат отделения нейрохирургии: 4 врача-нейрохирурга (плюс 3 врача-нейрохирурга в составе отделения экстренной хирургической помощи), 15 медицинских сестер, 10 сотрудников младшего персонала, всего 29 штатных единиц.
В отделении работают 3 кандидата медицинских наук, 3 врача высшей квалификационной категории.
Научными консультантами отделения являются нейрохирурги: профессора В.Е. Парфенов (Санкт-Петербург) и Э. Чеснулис (Цюрих). Официальным международным партнером отделения нейрохирургии ВЦЭРМа является нейрохирургическая клиника Швейцарского нейроинститута Хирсланден (г. Цюрих, Швейцария).